Jakie badania prowadzimy?
W ramach projektu Zespół pod przewodnictwem prof. Magdaleny Frąc z Zakładu Badań Systemu Gleba-Roślina Instytutu Agrofizyki PAN prowadzi kompleksowe, nowoczesne badania nad mikrobiomem glebowym i roślinnym w ujęciu koncepcji holobiontu. Obejmują one zarówno analizy laboratoryjne, jak i eksperymenty polowe. Kluczowe obszary badawcze to:
🔬 1. Badania metataksonomiczne i bioinformatyczne
- Analiza danych dotyczących składu mikrobiomu (bakterii i grzybów) w ryzosferze i częściach nadziemnych roślin.
- Wykorzystanie zaawansowanych narzędzi bioinformatycznych do interpretacji danych z sekwencjonowania nowej generacji (NGS).
- Łączenie wyników z baz danych z wcześniejszych projektów krajowych i międzynarodowych.
🧪 2. Sekwencjonowanie mikrobiomów roślin
- Izolacja DNA z próbek glebowych i roślinnych.
- Sekwencjonowanie mikroorganizmów zasiedlających korzenie i części nadziemne co najmniej 70 gatunków roślin, w tym zbóż, warzyw, ziół, roślin sadowniczych i ozdobnych.
- Porównania różnorodności mikrobiologicznej w różnych typach upraw i warunkach środowiskowych.
🌱 3. Eksperymenty polowe
- Zakładanie doświadczeń terenowych na różnych stanowiskach uprawowych.
- Pobieranie próbek gleb i roślin w różnych fazach wzrostu.
- Pomiary właściwości gleby (np. pH, zawartość materii organicznej) i zdrowotności roślin.
🧬 4. Tworzenie biobanku materiału badawczego
- Gromadzenie, katalogowanie i przechowywanie próbek gleby, korzeni i części nadziemnych roślin.
- Utworzenie zasobu badawczego dostępnego dla przyszłych analiz mikrobiologicznych, genetycznych i biochemicznych.
📲 5. Opracowanie aplikacji HoloBIOme
- Integracja wyników badań w formie ogólnodostępnej mobilnej aplikacji.
- Przedstawienie charakterystyki holobiontu roślinnego dla różnych gatunków upraw.
- Zastosowanie aplikacji w edukacji, doradztwie rolniczym i popularyzacji wiedzy o mikrobiomach.