Badania

Jakie badania prowadzimy?

W ramach projektu Zespół pod przewodnictwem prof. Magdaleny Frąc z Zakładu Badań Systemu Gleba-Roślina Instytutu Agrofizyki PAN prowadzi kompleksowe, nowoczesne badania nad mikrobiomem glebowym i roślinnym w ujęciu koncepcji holobiontu. Obejmują one zarówno analizy laboratoryjne, jak i eksperymenty polowe. Kluczowe obszary badawcze to:

🔬 1. Badania metataksonomiczne i bioinformatyczne

  • Analiza danych dotyczących składu mikrobiomu (bakterii i grzybów) w ryzosferze i częściach nadziemnych roślin.
  • Wykorzystanie zaawansowanych narzędzi bioinformatycznych do interpretacji danych z sekwencjonowania nowej generacji (NGS).
  • Łączenie wyników z baz danych z wcześniejszych projektów krajowych i międzynarodowych.

🧪 2. Sekwencjonowanie mikrobiomów roślin

  • Izolacja DNA z próbek glebowych i roślinnych.
  • Sekwencjonowanie mikroorganizmów zasiedlających korzenie i części nadziemne co najmniej 70 gatunków roślin, w tym zbóż, warzyw, ziół, roślin sadowniczych i ozdobnych.
  • Porównania różnorodności mikrobiologicznej w różnych typach upraw i warunkach środowiskowych.

🌱 3. Eksperymenty polowe

  • Zakładanie doświadczeń terenowych na różnych stanowiskach uprawowych.
  • Pobieranie próbek gleb i roślin w różnych fazach wzrostu.
  • Pomiary właściwości gleby (np. pH, zawartość materii organicznej) i zdrowotności roślin.

🧬 4. Tworzenie biobanku materiału badawczego

  • Gromadzenie, katalogowanie i przechowywanie próbek gleby, korzeni i części nadziemnych roślin.
  • Utworzenie zasobu badawczego dostępnego dla przyszłych analiz mikrobiologicznych, genetycznych i biochemicznych.

📲 5. Opracowanie aplikacji HoloBIOme

  • Integracja wyników badań w formie ogólnodostępnej mobilnej aplikacji.
  • Przedstawienie charakterystyki holobiontu roślinnego dla różnych gatunków upraw.
  • Zastosowanie aplikacji w edukacji, doradztwie rolniczym i popularyzacji wiedzy o mikrobiomach.